Se encuentra ubicada en el sector sudoeste de la República del Paraguay, sobre la costa derecha del Río Paraná. Además, el sitio es capital del departamento de Itapúa. También está a una altura de entre 85 y 100 metros sobre el nivel del mar. Por otra parte, Encarnación cuenta con una superficie total de 558 kilómetros cuadrados y en ella habitan 104.944 personas según el censo realizado en el año 2002.
En lo que refiere al clima, se puede decir que es subtropical y que la localidad no posee estación seca. Si bien su media anual es de 25 grados, las temperaturas en invierno llegan a un grado bajo cero y en verano a 39 grados.
La localidad es uno de los centros comerciales más grandes del país. La misma se halla conectada, a través del puente carretero - ferroviario Roque González de Santa Cruz, con la ciudad de Posadas en la República Argentina.
En su país, la ciudad está considerada como la tercera más importante a nivel económico. Se encuentra detrás de Ciudad del Este.
En lo que refiere al turismo, el sitio también se ubica como uno de los más destacados de la región ya que cuenta con hoteles, alojamientos y locales gastronómicos de hasta cinco estrellas.
Dentro de los sitios más destacados para visitar se encuentran: Misiones Jesuíticas Jesús de Tabarangué, estas ruinas fueron creadas a orillas del Río Monday en el año 1678. Sin embargo, el asentamiento debió mudarse en varias ocasiones por los constantes asedios que recibía de las tribus provenientes del Brasil. Es por eso que hoy en día el lugar se halla a solo 38 kilómetros de Encarnación.
Por último, es preciso destacar que otro sitio muy bellos para visitar es el oratorio de la Virgen de Itacua. El cual se halla a solo nueve kilómetros de la ciudad de Encarnación, cerca de un sitio llamado Punta Itacua. En el lugar se halla una imagen de la Virgen de Itacua, también conocida como Virgen de los pobres. En el sitio también se halla una gruta.
Se puede llegar desde cualquier punto del mundo al Aeropuerto Internacional de Asunción, desde allí se debe tomar la Ruta Número uno "Mariscal Francisco Solano López" hasta Encarnación.